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抗原AI预测体系

1. 高性能计算能力:

  • 智能信息部门拥有三台高性能计算服务器节点,具备超过400个CPU核心和先进的GPU(包括2个H100和4个3090),内存超过4T,存储空间超过200T。这一配置在国内疫苗开发公司中处于领先地位,完全满足当前算法开发和应用需求。

2. AI模型与专利成就:

  • 经过近三年的研发,部门构建了基于公开数据的AI模型,专注于预测靶点表位的免疫原性。该方法已申请并获得3项专利授权,并在2022年发表论文《A Highly Effective System for Predicting MHC-II Epitopes With Immunogenicity》。此方法在行业中处于领先地位,极大提高模式动物实验的预测率(接近100%)。

3. 跨物种抗原靶点预测:

  • 独立开发了基于结构计算的跨物种抗原靶点预测方法。运用自研的口袋占据分析方法,精准判定MHC2与peptide的结合强度,有效预测多个物种的有效抗原片段(左图)。通过比较目前主流的预测方法,叠加自研的筛选预测流程,澄实生物建立了一套平衡算力和精确度的流程(右图)。

4. mRNA优化算法CSFOLD:

  • CSFOLD算法在抗降解和提高翻译速率方面表现出色,目标是产生更多的氨基酸序列。相比行业标杆LinearDesign,CSFOLD展现了更优的性能。在对合成mRNA进行的降解测试中,澄实生物的结果表明通过csfold设计的序列经过IVT产生的mRNA的纯度以及极端环境的抗降解性能两方面具有显著优势。

澄实生物医药科技通过这些先进的技术和方法,不断推动生物医药领域的创新和发展,为客户提供优质的产品和服务。

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